Além de ter seus próprios programas, o Instituto Ethos também apóia programas capitaneados por outras organizações e entidades, inclusive internacionais. Para que isso ocorra é necessário que o programa proposto se enquadre nos compromissos do Instituto Ethos com seus associados e com a sociedade. Os programas apoiados são o Fórum Amazônia Sustentável e Nossa São Paulo Outra Cidade.